JBrowse

Um navegador genômico para desktop que permite abrir e explorar dados genômicos no macOS.

CaskEducação e pesquisaApple Silicon · Intel
Fonte homebrew/cask
Instalações nos últimos 30 dias2Appsº lugar: 3445
Instalações no último ano207Total em 365 dias
Versão mais recente4.3.021 de mai. · 21 de mai.
Tamanho do download253MBarm64 / x86_64 · dmg
Frequência de atualizaçõesA cada duas semanas0 versão nos últimos 30 dias

Descrição

JBrowse é um navegador genômico disponível como aplicativo para desktop, na web e para incorporação em outros aplicativos. Este cask do Homebrew instala a edição para desktop, cujo nome é JBrowse 2.app.

O projeto apresenta o JBrowse como uma ferramenta para visualizar genomas. A documentação descreve estas capacidades:

  • Abrir um genoma no aplicativo para desktop.
  • Visualizar dados genômicos por meio de visualizações no navegador, incluindo visualizações de sintenia e variação estrutural.
  • Configurar e ampliar o JBrowse; o projeto oferece guias para usuários, configuração e desenvolvimento, além de orientações para criar plugins.
  • Incorporar visualizações ou componentes genômicos em outros aplicativos.

Para instalar o aplicativo para desktop, execute brew install --cask jbrowse e depois abra JBrowse 2.app em Aplicativos. É necessário ter macOS 12 ou posterior.

O site do projeto também descreve o uso na web e a incorporação em outros aplicativos, mas este cask instala somente o aplicativo para desktop. O projeto informa que o software é distribuído sob a Apache License, Version 2.0.

Fontes: JBrowse · Cask do Homebrew

Novidades Novidades da versão 4.3.0 21 de mai. · Editoria OpenNavo · Tradução por IA

  • RecursosbedMethyl é carregado automaticamente como track multiquantitativa.
  • SiteO site agora usa Astro em vez de Docusaurus.
  • TestesA refatoração de GPU continua; usuários são convidados a testá-la.

Interface gráfica de código aberto para Homebrew. Instalações feitas pelo cliente macOS ou pelo comando brew.

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